Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC1

VPS39, Vam6/Vps39-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS39Q96JC1 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS39Q96JC1 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
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VPS39Q96JC1 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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VPS39Q96JC1 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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VPS39Q96JC1 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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VPS39Q96JC1 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS39Q96JC1 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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