Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF3C6Q969F1 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF3C6Q969F1 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF3C6Q969F1 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF3C6Q969F1 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF3C6Q969F1 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF3C6Q969F1 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF3C6Q969F1 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF3C6Q969F1 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms