Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-CQ95604 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-CQ95604 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms