Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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CHCHD4Q8N4Q1 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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CHCHD4Q8N4Q1 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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CHCHD4Q8N4Q1 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
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CHCHD4Q8N4Q1 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHCHD4Q8N4Q1 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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