Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
USP43Q70EL4 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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