Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MSMPQ1L6U9 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
MSMPQ1L6U9 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
MSMPQ1L6U9 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
MSMPQ1L6U9 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
MSMPQ1L6U9 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
MSMPQ1L6U9 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
MSMPQ1L6U9 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
MSMPQ1L6U9 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
MSMPQ1L6U9 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
MSMPQ1L6U9 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
MSMPQ1L6U9 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
MSMPQ1L6U9 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
MSMPQ1L6U9 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
MSMPQ1L6U9 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
MSMPQ1L6U9 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
MSMPQ1L6U9 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
MSMPQ1L6U9 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms