Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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PTPROQ16827 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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PTPROQ16827 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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PTPROQ16827 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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PTPROQ16827 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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PTPROQ16827 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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PTPROQ16827 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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