Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ME3Q16798 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ME3Q16798 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ME3Q16798 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ME3Q16798 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ME3Q16798 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ME3Q16798 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ME3Q16798 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ME3Q16798 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ME3Q16798 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ME3Q16798 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
ME3Q16798 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ME3Q16798 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ME3Q16798 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms