Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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