Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FSCN1Q16658 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms