Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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SGCAQ16586 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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SGCAQ16586 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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SGCAQ16586 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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SGCAQ16586 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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