Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms