Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms