Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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COL19A1Q14993 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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COL19A1Q14993 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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