Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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