Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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COL4A6Q14031 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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COL4A6Q14031 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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COL4A6Q14031 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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COL4A6Q14031 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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COL4A6Q14031 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL4A6Q14031 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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