Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
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