Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1SQ13698 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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