Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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