Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SP140Q13342 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SP140Q13342 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SP140Q13342 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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