Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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