Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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SEMA3FQ13275 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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SEMA3FQ13275 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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SEMA3FQ13275 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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SEMA3FQ13275 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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SEMA3FQ13275 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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SEMA3FQ13275 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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