Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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ERCC8Q13216 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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ERCC8Q13216 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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ERCC8Q13216 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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