Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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FOXC1Q12948 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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