Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2E1P29083 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
GTF2E1P29083 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
GTF2E1P29083 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2E1P29083 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2E1P29083 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2E1P29083 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2E1P29083 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms