Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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HOXD10P28358 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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