Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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PTPREP23469 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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