Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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