Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms