Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM35Q9UPQ4 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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