Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TMOD4Q9NZQ9 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms