Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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