Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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LINC00336Q6ZUF6 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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LINC00336Q6ZUF6 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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LINC00336Q6ZUF6 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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LINC00336Q6ZUF6 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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LINC00336Q6ZUF6 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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LINC00336Q6ZUF6 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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LINC00336Q6ZUF6 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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LINC00336Q6ZUF6 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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LINC00336Q6ZUF6 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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LINC00336Q6ZUF6 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LINC00336Q6ZUF6 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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