Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms