Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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TRAF7Q6Q0C0 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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TRAF7Q6Q0C0 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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TRAF7Q6Q0C0 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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TRAF7Q6Q0C0 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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TRAF7Q6Q0C0 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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TRAF7Q6Q0C0 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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TRAF7Q6Q0C0 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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TRAF7Q6Q0C0 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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TRAF7Q6Q0C0 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF7Q6Q0C0 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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