Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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