Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms