Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC85BQ15834 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms