Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HMGN3Q15651 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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