Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms