Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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TTF1Q15361 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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