Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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