Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
SCARF1Q14162 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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