Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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GTF2H2Q13888 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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GTF2H2Q13888 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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GTF2H2Q13888 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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GTF2H2Q13888 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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GTF2H2Q13888 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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