| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.695-201 | ENST00000516715 | 107 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090739.1-201 | ENST00000522190 | 708 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SETP7-201 | ENST00000552169 | 453 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL135746.1-201 | ENST00000554205 | 547 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00640-203 | ENST00000556479 | 576 nt | TSL 2 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157394.1-201 | ENST00000562983 | 1224 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC141273.1-201 | ENST00000565300 | 479 nt | TSL 5 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCYBP33-201 | ENST00000575007 | 1130 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3945-201 | ENST00000581853 | 98 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4435-1-201 | ENST00000582552 | 80 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01928-201 | ENST00000591029 | 504 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC012065.4-201 | ENST00000602445 | 679 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004853.1-201 | ENST00000604902 | 698 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104010.1-201 | ENST00000616889 | 150 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018755.4-201 | ENST00000619715 | 454 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC139792.2-201 | ENST00000624218 | 587 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DCLRE1A-202 | ENST00000369305 | 4241 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC244517.1-201 | ENST00000606030 | 2086 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OGN-202 | ENST00000375561 | 2743 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF639-206 | ENST00000484866 | 1730 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02510-201 | ENST00000509798 | 1576 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | POLK-217 | ENST00000515295 | 1438 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FMN2-207 | ENST00000545751 | 1913 nt | TSL 5 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCDC30-203 | ENST00000428554 | 3063 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LTN1-201 | ENST00000361371 | 7685 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.201-201 | ENST00000364052 | 96 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-501P-201 | ENST00000364072 | 100 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.234-201 | ENST00000364409 | 97 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00587-201 | ENST00000374801 | 590 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA46-201 | ENST00000384762 | 135 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAJ17-201 | ENST00000390520 | 63 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRPL30-202 | ENST00000409145 | 562 nt | TSL 2 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP21-201 | ENST00000410917 | 96 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091705.1-201 | ENST00000412197 | 209 nt | TSL 5 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC109780.2-201 | ENST00000413467 | 845 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | B3GALNT1P1-201 | ENST00000420569 | 975 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006366.1-201 | ENST00000422002 | 759 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC107081.2-201 | ENST00000425779 | 802 nt | TSL 5 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL353706.1-201 | ENST00000436728 | 494 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC019330.1-202 | ENST00000440609 | 504 nt | TSL 4 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | COX6CP12-201 | ENST00000446748 | 202 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000542.1-201 | ENST00000448473 | 371 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PAXBP1P1-201 | ENST00000449315 | 447 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNRPGP9-201 | ENST00000456025 | 225 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CSN1S1-202 | ENST00000505782 | 871 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006390.1-201 | ENST00000508068 | 283 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006445.2-201 | ENST00000510061 | 472 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TXNP6-201 | ENST00000510190 | 310 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-29P-201 | ENST00000515943 | 174 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP004247.1-201 | ENST00000531556 | 1289 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068587.4-201 | ENST00000533893 | 186 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SMILR-201 | ENST00000533992 | 553 nt | TSL 4 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02235-201 | ENST00000534675 | 466 nt | TSL 5 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02460-201 | ENST00000543558 | 536 nt | TSL 4 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NDUFAF4P1-201 | ENST00000559425 | 519 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091489.2-201 | ENST00000566263 | 604 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC044873.1-201 | ENST00000580487 | 399 nt | TSL 3 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNRPGP15-201 | ENST00000600149 | 222 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073544.2-201 | ENST00000601155 | 540 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012669.1-201 | ENST00000603209 | 283 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC064872.1-201 | ENST00000604823 | 1072 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP299-201 | ENST00000606679 | 301 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL109811.3-202 | ENST00000612387 | 651 nt | TSL 3 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C17orf112-201 | ENST00000623702 | 835 nt | TSL 2 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010149.2-201 | ENST00000637608 | 315 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TFEC-202 | ENST00000320239 | 6605 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR2L2-203 | ENST00000642011 | 4225 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FOXP2-210 | ENST00000403559 | 6415 nt | TSL 2 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | THUMPD3P1-201 | ENST00000506556 | 1480 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-335P-201 | ENST00000364563 | 113 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-744P-201 | ENST00000365557 | 107 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1316P-201 | ENST00000384242 | 108 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-769P-201 | ENST00000384407 | 104 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U8.14-201 | ENST00000390843 | 143 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR320C1-201 | ENST00000408566 | 88 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-712P-201 | ENST00000410558 | 100 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS27L-202 | ENST00000411926 | 528 nt | TSL 3 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRPL50P2-201 | ENST00000416821 | 482 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TOMM22P1-201 | ENST00000418578 | 312 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00392-201 | ENST00000430033 | 557 nt | TSL 3 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DLGAP5P1-201 | ENST00000430307 | 464 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND1P28-201 | ENST00000435623 | 950 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP002512.3-201 | ENST00000440231 | 985 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NUTM2A-AS1-209 | ENST00000447424 | 571 nt | TSL 3 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P52-201 | ENST00000449200 | 742 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB1P15-201 | ENST00000453854 | 435 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR6K1P-201 | ENST00000456766 | 971 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO2P18-201 | ENST00000457151 | 658 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104563.1-201 | ENST00000476147 | 376 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FSBP-201 | ENST00000481490 | 1158 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091435.1-201 | ENST00000505442 | 584 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02469-201 | ENST00000506460 | 741 nt | TSL 3 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022447.3-201 | ENST00000506865 | 495 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | POU5F1P7-201 | ENST00000508759 | 541 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC098868.1-201 | ENST00000512628 | 624 nt | TSL 2 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026991.1-201 | ENST00000520815 | 463 nt | TSL 3 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PPFIA2-AS1-205 | ENST00000550938 | 790 nt | TSL 3 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090049.1-201 | ENST00000551075 | 1011 nt | TSL 3 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCMTD1P2-201 | ENST00000565017 | 355 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |