Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms