Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms