Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCIRG1Q13488 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms