Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms