Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NME3Q13232 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NME3Q13232 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NME3Q13232 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms