Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms